Naja! Es sind ja keine Keime. Ich denke, dass wenn man das Substrat im Backofen durcherhitzt, sollten Insekten und ihre Eier tot sein.
Substrat auf ein Backblech tun (ggf. Alufolie darunter und als Rand), anfeuchten und solange backen, bis auch im Inneren alles sehr heiß ist. 30 Minuten sollte reichen. Man kann ja mehrere Bleche auf einmal backen.
Im Gartenbau macht man das auch so, nur in größerem Maßstab.
Du musst abwägen, ob dir der Aufwand richtig erscheint.
Marco
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