Hallo Stefanie,

mit den Wurzeln gebe ich den Kollegen recht, das ist ziemlich sicher zu feuchtes Substrat. Die Flecken sind schwieriger. Schildläuse lassen sich eigentlich ohne viel Kraft abheben und meistens findet man sie in unterschiedlichen Größen. Ausserdem kann man die Körpergliederung zumindest mit einer Lupe ganz gut sehen. Die Flecken lassen mich eher an "Rostflecken" denken, das können verschiedenste Pilze sein. Der Schaden kann dann sehr unterschiedlich sein, nach meiner Erfahrung ist das aber eher selten ein Totalverlust und auch die Verbreitung in der Sammlung ist nicht so rapide. Isolieren und lokal oder systemisch mit einem Pilzmittel behandeln würde ich es aber schon. Den genauen Erreger kann man wohl nur im Labor feststellen (wenn meine Annahme denn stimmt).
Ich empfehle zum Thema die neueste Publikation der DKG, die sich ausführlich mit Pflanzenschutz bei Kakteen beschäftigt.

Hawkeye